井冈山综合保税区的前身为井冈山出口加工区，位于国家级井冈山经济技术开发区内，规划面积0.48平方公里，2011年3月经国务院批准设立，2013年4月封关运行。2020年4月27日经国务院批复同意整合优化为综合保税区，2021年1月6日获海关总署批复同意验收合格并封关运行。是我省继南昌、九江、赣州后获批的第四个国家级综合保税区，是吉安乃至江西打造内陆开放型经济试验区的又一重要国家级平台。
井冈山综保区围绕建设赣中地区加工制造中心、保税物流中心、电子产品检测维修基地和跨境电商基地“两中心、两基地”，打造“革命老区开放新引擎、吉安内陆开放桥头堡、园区集约发展示范区、营商环境新高地”，成为发展最集约、特色最鲜明、服务最优、效益最好的“四最”综合保税区。区内现有20万平方米的标准厂房13栋，2万平方米仓库3栋，以及7000平方米的查验场地。现有生产经营企业48家，其中加工制造类企业7家，跨境电商类企业35家，检测维修类企业1家，保税物流（综合服务）类企业5家。在2022年度井冈山综保区发展绩效评估位列全国第92位，评估结果为B类，相较于上年度前进了1位。2023年获批江西省首批省级跨境电商产业园，2023年1-12月，综保区实现一线进出口总值42.6亿元，其中进口14.05亿元，出口28.58亿元。
