2002年10月,佛光大学与马来西亚孝恩文化基金会签署了一项学术协议,联合开办传播、企业管理、社会工作及历史4项硕士课程,培养大马华裔研究人才以"论文硕士"方式取得学位,共同努力为本地学术研究作出贡献。课程在马来西亚进行,以指导研究为主,佛光大学教授将亲临马来西亚教授,师生比率不超过1比3。学制1年半至2年,分成6个学期,研究生只须于最后一个学期赴佛光大学修读"马来西亚研究"课程并进行论文答辩。